Příspěvek konference
Ontologie a získávání znalostí v biomedicíně
Autor
Vendula Papíková, Akademie věd České republiky - Ústav informatiky - Oddělení medicínské informatiky, Praha
Materiály ke stažení
Abstrakt
Textový dokument je převažujícím způsobem sdělování informací mezi vědci. Objem vědecké literatury roste tak rychle, že je obtížné najít a zpravovat obrovské množství publikovaných informací. Nástroje pro efektivní a inteligentní dobývání informací z elektronických textových databází se vyvíjejí v poslední době ve všech oblastech výzkumu včetně biomedicíny. Tato práce shrnuje hlavní principy fungování nástrojů pro analýzu textu a ukazuje na klíčovou úlohu biomedicínských ontologií pro automatizovanou extrakci informací, vytváření hypotéz a získávání znalostí. Jsou uvedeny a stručně popsány příklady vybraných aplikací.
Profesní informace o autorovi
MUDr. Vendula Papíková, PhD., vystudovala 1. LF UK v Praze, v roce 1996 získala atestaci I. st. v oboru vnitřní lékařství a v roce 2000 atestaci I. st. z klinické biochemie. V roce 2009 obhájila dizertační práci v oboru Informační věda. Pracovala jako lékařka na několika klinických pracovištích a jako odborná asistentka na 2. Ústavu lékařské chemie a biochemie (nyní Ústav biochemie a experimentální onkologie) 1. LF UK v Praze. V letech 1997 – 1999 působila ve farmaceutické firmě Ferring – Léčiva jako poradce pro bezpečnost léků a poradce pro vědecké lékařské informace. V roce 2001 absolvovala krátkodobý studijní pobyt na vybraných univerzitách USA se zaměřením na diagnostiku dědičných metabolických poruch a na problematiku medicíny založené na důkazech (EBM). Od roku 2006 do současnosti pracuje na Oddělení medicínské informatiky v Ústavu informatiky Akademie věd ČR, v.v.i.
